Autoimunitas adalah suatu kelainan dimana sistem kekebalan tubuh menyerang jaringan tubuh sendiri. Contoh penyakit autoimunitas adalah penyakit Addison kelenjar adrenal , teroiditis, atritis rematoid, multiple sclerosis, anemia pernisisus, dan lupus.

Pada artritis rematoid, penyebebnya diduga dipicu oleh infeksi virus dan bakteriyang memiliki molekul permukaan mirip dengan molekul pada persendian. Ketika tubuh dirangsang untuk menyerang molekul asing, jaringan pada sendi juga ikut terserang karena kemiripan molekul tersebut.